Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms