Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms