Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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