Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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