Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT1P21579 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT1P21579 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT1P21579 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT1P21579 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT1P21579 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT1P21579 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT1P21579 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms