Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms