Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms