Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOP08100 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOP08100 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOP08100 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOP08100 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOP08100 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOP08100 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOP08100 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOP08100 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms