Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX3O95343 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX3O95343 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SIX3O95343 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX3O95343 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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