Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ZNF253O75346 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ZNF253O75346 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ZNF253O75346 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ZNF253O75346 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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ZNF253O75346 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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ZNF253O75346 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF253O75346 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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