Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms