Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms