Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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