Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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COG4Q9H9E3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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COG4Q9H9E3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COG4Q9H9E3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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