Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms