Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms