Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms