Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms