Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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NOTCH4Q99466 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NOTCH4Q99466 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NOTCH4Q99466 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NOTCH4Q99466 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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