Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms