Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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