Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms