Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C17orf47Q8NEP4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms