Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF449Q6P9G9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF449Q6P9G9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF449Q6P9G9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF449Q6P9G9 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF449Q6P9G9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF449Q6P9G9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF449Q6P9G9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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