Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STRIP1Q5VSL9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms