Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf50Q5SZB4 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf50Q5SZB4 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf50Q5SZB4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf50Q5SZB4 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf50Q5SZB4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf50Q5SZB4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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C9orf50Q5SZB4 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf50Q5SZB4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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