Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms