Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ERVV-2-201ENST00000601417 2431 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM198B-202ENST00000478241 2924 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC026746.1-201ENST00000505623 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GRPEL1-201ENST00000264954 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 FPR1-201ENST00000304748 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 LRTOMT-222ENST00000615940 1895 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms