Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms