Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LETM2Q2VYF4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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