Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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