Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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