Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDKN3Q16667 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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