Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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