Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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