Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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ZNF56Q15929 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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ZNF56Q15929 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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ZNF56Q15929 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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ZNF56Q15929 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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ZNF56Q15929 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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ZNF56Q15929 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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ZNF56Q15929 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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