Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITSN1Q15811 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITSN1Q15811 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms