Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCEA2Q15560 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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