Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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