Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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