Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms