Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms