Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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