Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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