Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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