Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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AP3B2Q13367 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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AP3B2Q13367 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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AP3B2Q13367 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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AP3B2Q13367 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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AP3B2Q13367 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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AP3B2Q13367 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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