Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms