Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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