Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms