Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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